2159年，M国不慎击落了一只天琴星飞船，天琴星人前来讨要残骸和尸体，M国军方拒绝归还。天琴星人扬言，不归还，就毁灭地球。地球和全人类的命运遭遇严峻挑战，中情局特派探员马如龙，乘坐时光穿梭机返回亚特兰蒂斯，去寻找那颗失落在历史深处的水晶骷髅头骨，那里面载有拯救人类、破解危机的科技信息。马如龙来到12000年前的亚特兰蒂斯，进入一个死人的大脑，易形重生，变成探员李察，经过九死一生，闯过重重险关，与机器人斗智斗勇，终于找到了水晶头骨，但意外的事情又发生了……